Le Parc national de la Comoé étant situé à la transition entre les domaines phytogéographiques soudanien et guinéen, la faune est constituée d’une grande diversité d’espèces caractéristiques :
- de la savane : grandes antilopes grégaires et leurs prédateurs, oiseaux vivant au sol comme le Grand Calao d’Abyssinie, les outardes, pintades et francolins ;
- de la forêt : espèces arboricoles, avec de nombreux primates dont le Chimpanzé, ou des espèces terrestres caractérisées, comme les antilopes forestières ;
- mais, aussi, de plusieurs espèces ubiquistes montrant une grande plasticité écologique, à l’image du Guib harnaché, de l’Eléphant ou du Buffle.
Les études réalisées au PNC ont permis de faire l’état de présence de :
- 135 espèces de mammifères (68 de grandes espèces, 27 pour rongeurs et insectivores, 40 pour les Chiroptères)
- 35 espèces d’amphibiens
- 60 espèces de poissons
- 71 espèces de reptiles : crocodiles et varans etc.
- 497 espèces d’oiseaux.
Parmi ces espèces, on distingue des espèces menacées inscrites sur la liste rouge de l’UICN notamment le Lycaon (Lycaon pictus) dont la présence était exceptionnelle lors de la création du parc, le Chimpanzé (Pan troglodytes), l’Eléphant (Loxodonta africana), le Lion (Panthera leo), la Panthère (Panthera pardus), le Bongo (Tragelaphus euryceros), le Crocodile à nuque cuirassée (Mecistops cataphractus), le Pangolin géant (Manis gigantea), le Pangolin à écailles tricuspides (Manis tricuspis), le Grand Serpentaire (Sagittarius serpentar), l’Outarde de Denham (Neotis denhami), etc.
Chez les antilopes présentes dans toute l’Afrique soudano-zambézienne, les espèces sont représentées par leur race occidentale :
- Hippotrague (Hippotragus equinus koba) ;
- Bubale (Alcelaphus buselaphus major) ;
- Cobe Defassa (Kobus defassa unctuosus) ;
- Cephalophe de Maxwell (Cephalophus monticola maxwellii)
L’avifaune comprend 497 espèces d’oiseaux dont 5 espèces menacées à l’échelle mondiale (Circus macrourus, Falco naumanni, Gallinago media ; Ceratogymna elata et C. cylindricus).
